Гербарии России: роль в изучении биоразнообразия страны, проблемы сохранения и рационального использования

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Для сохранения биоразнообразия на Земле необходимо в кратчайшие сроки провести инвентаризацию всех форм жизни, и эта задача особенно актуальна для малоизученных территорий. Наземные и водные экосистемы России представляют собой самый большой массив естественных внетропических экосистем Евразии. Для решения задачи инвентаризации флоры и фауны особую значимость приобретают биологические коллекции; в целом ряде обзоров привлекается внимание научного и гражданского сообщества к проблеме сохранения и все более широкого применения коллекций. В данной статье исследуется роль гербариев в изучении биоразнообразия России на основе количественного анализа коллекций страны, степени их цифровизации и интеграции в глобальную мировую сеть биологических коллекций. Сделан вывод, что гербарный фонд России недостаточен по количеству образцов и неравномерно распределен по регионам, наименьшее количество образцов растений имеется для ряда регионов северо-востока России. Около половины всех российских гербариев не зарегистрированы в Index Herbariorum, соответственно, не интегрированы в мировую информационную систему по биоразнообразию. Здесь же освещается проблема сохранности гербарных коллекций, намечаются пути ее решения и перспективы использования гербариев в будущем. Авторы полагают, что первоочередными мерами должны быть: 1) формирование нормативно-правовой базы по работе с биоколлекциями, которая, в частности, позволит признать гербарные коллекции объектами культурного и научного наследия, обеспечить специальное финансирование коллекций; 2) введение в практику централизованного учета российских гербариев и включение их в международную базу данных; 3) запрет на списание гербарных коллекций организациями; 4) увеличение темпов цифровизации ботанических коллекций; 5) комплектование гербариев кадровыми исследователями; введение в профильных вузах курса по гербарному делу; 6) выделение для гербариев отдельных помещений, оборудованных специализированными шкафами и вентиляцией.

Об авторах

Э. В. Гарин

Институт биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: garinev@ibiw.ru
Россия, 152742, Некоузский р-н, пос. Борок, 109

Д. В. Гарина

Институт биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина РАН

Email: garinev@ibiw.ru
Россия, 152742, Некоузский р-н, пос. Борок, 109

Список литературы

  1. Алимов А.Ф., Алтухов Ю.П., Амирханов А.М., Бобылев С.Н., Боголюбов С.А. и др., 2001. Национальная стратегия сохранения биоразнообразия России. М.: Проект ГЭФ “Сохранение биоразнообразия”. 76 с.
  2. Ботанические коллекции – национальное достояние России, 2015. Сб. науч. статей Всеросс. (с междунар. участием) науч. конф., посвящ. 120-летию Гербария им. И.И. Спрыгина и 100-летию Русского ботанического общества (г. Пенза, 17–19 февраля 2015 г.) / Под ред. Новиковой Л.А. Пенза: Изд-во ПГУ. 408 с.
  3. Гарин Э.В., 2015а. Гербарий ИБВВ РАН на современном этапе // Ботанические коллекции – национальное достояние России: сб. науч. статей Всеросс. (с междунар. участием) науч. конф., посвящ. 120-летию Гербария им. И.И. Спрыгина и 100-летию Русского ботанического общества. Пенза: Изд-во ПГУ. С. 28–30.
  4. Гарин Э.В., 2015б. К вопросу о частных гербариях // Ботанические коллекции – национальное достояние России: сб. науч. статей Всеросс. (с междунар. участием) науч. конф., посвящ. 120-летию Гербария им. И.И. Спрыгина и 100-летию Русского ботанического общества. Пенза: Изд-во ПГУ. С. 31–33.
  5. Гарин Э.В., 2015в. Манжетка Литвинова в Тверской и Ярославской областях по фондам Гербария ИБВВ РАН (IBIW) // Междунар. журн. прикл. и фунд. исследований. № 6–3. С. 514.
  6. Грубов В.И., Сергиенко Л.А., 1988. О состоянии гербариев в СССР // Бот. журн. Т. 73. № 10. С. 1507–1511.
  7. Гуреева И.И., 2010. Мировой гербарный фонд и его распределение // Бот. журн. Т. 95. № 11. С. 1658–1667.
  8. Гуреева И.И., 2013. Гербарное дело: Руководство по организации Гербария и работе с гербарными коллекциями. 2-е изд., испр. и доп. Томск: Изд-во Томск. ун-та. 194 с.
  9. Казанцев М.Ф., 2018. Правовое регулирование в сфере биологических коллекций: система, состояние, развитие // Науч. ежегодник ИФиП УрО РАН. Т. 18. № 1. С. 94–143. https://doi.org/10.17506/ryipl.2016.18.1.94143
  10. Камелин Р.В., Буданцев А.Л., Павлов В.Н., 2019. Растительный мир России // Большая российская энциклопедия. https://old.bigenc.ru/text/v/3038905
  11. Каменский П.А., Сазонов А.Э., Федянин А.А., Садовничий В.А., 2016. Биологические коллекции: стремление к идеалу // Acta Naturae. Т. 8. № 2. С. 6–10.
  12. Конституция Российской Федерации с поправками от 30.12.2008 № 6-ФКЗ, от 30.12.2008 № 7-ФКЗ, от 05.02.2014 № 2-ФКЗ, от 21.07.2014 № 11-ФКЗ, от 14.03.2020 № 1-ФКЗ, от 04.10.2022 № 5-ФКЗ, 6‑ФКЗ, 7-ФКЗ, 8-ФКЗ.
  13. Лавренко Е.М., Скворцов А.К., Тахтаджян А.Л., Тихомиров В.Н., Юрцев Б.А., 1973. Гербарии: значение для общества, современное состояние, перспективы // Изв. АН СССР. Сер. биол. № 1. С. 5–12.
  14. Серёгин А.П., 2002. География гербарного дела в России // География и регион. V. Биогеография и биоразнообразие Прикамья: мат-лы Междунар. науч.-практ. конф. Пермь. С. 224–226. https://doi.org/10.13140/2.1.4993.7609
  15. Серёгин А.П., 2003. Регистрация Гербариев в Index Herbariorum: российский пример // Вісн. Луганського нац. пед. ун-ту ім. Т.Г. Шевченка. Біол. науки. № 11. С. 69–72. https://doi.org/10.13140/2.1.1948.3840
  16. Скворцов А.К., 1973. Гербарий – основа систематической и географической ботаники // Природа. № 9. С. 2–9.
  17. Скворцов А.К., 1977. Гербарий. Руководство по методике и технике. М.: Наука. 199 с.
  18. Скворцов А.К., Проскурякова Г.М., 1973. Гербарий Главного ботанического сада АН СССР // Бот. журн. Т. 58. № 1. С. 155–161.
  19. Фомина Н.А., Антонова О.Ю., Чухина И.Г., Гавриленко Т.А., 2019. Гербарные коллекции в молекулярно-генетических исследованиях // Turczaninowia. Т. 22. № 4. C. 104–118. https://doi.org/10.14258/turczaninowia.22.4.12
  20. Хлёсткина Е.К., Захарова М.В., Нижников А.А., Гельтман Д.В., Чернецов Н.С. и др., 2022. Первый научный форум “Генетические ресурсы России” – о правовом регулировании в сфере биоресурсов и биологических коллекций // Биотехнология и селекция растений. Т. 5. № 2. С. 48–54. https://doi.org/10.30901/2658-6266-2022-2-o2
  21. Чеченкина Т.В., Сотникова М.В., 2019. Можно ли оценить бесценное? К вопросу о сравнении стоимости научных коллекций // Управление наукой и наукометрия. Т. 14. № 4. С. 567–583. https://doi.org/10.33873/2686-6706.2019.14-4.567-583
  22. Шиян Н.М., 2011. Гербарії України. Index Herbariorum Ucrainicum. Київ: “Альтерпрес”. 442 с.
  23. Юрцев Б.А., Тихомиров В.Н., Скворцов А.К., 1991. Гербарии взывают о помощи // Вестн. АН СССР. № 2. С. 131–135.
  24. Bakker F.T., 2019. Herbarium genomics: Plant archival DNA explored // Paleogenomics, Population Genomics / Eds Lindqvist C., Rajora O.P. Switzerland: Springer Nature. P. 205–224. https://doi.org/10.1007/978-3-030-04753-5
  25. Bakker F.T., Bieker V.C., Martin M.D., 2020. Editorial: Herbarium collection-based plant evolutionary genetics and genomics // Front. Ecol. Evol. V. 8. Art. 603948. https://doi.org/10.3389/fevo.2020.603948
  26. Bakker F.T., Lei D., Yu J., Mohammadin S., Wei Z. et al., 2016. Herbarium genomics: Plastome sequence assembly from a range of herbarium specimens using an iterative organelle genome assembly pipeline // Biol. J. Linn. Soc. V. 117. P. 33–43. https://doi.org/10.1111/bij.12642
  27. Bertuol-Garcia D., Morsello C., El-Hani C.N., Pardini R., 2018. A conceptual framework for understandingthe perspectives on the causes of the science – practice gap in ecology and conservation // Biol. Rev. Camb. Philos. Soc. V. 93. № 2. P. 1032–1055. https://doi.org/10.1111/brv.12385
  28. Buerki S., Baker W.J., 2016. Collections-based research in the genomic era // Biol. J. Linn. Soc. V. 117. № 1. P. 5–10. https://doi.org/10.1111/bij.12721
  29. Crisci J.V., Katinas L., Apodaca M.J., Hoch P.C., 2020. The end of botany // Trends Plant Sci. V. 25. № 16. P. 1173–1176. https://doi.org/10.1016/j.tplants.2020.09.012
  30. Feeley K., 2012. Distributional migrations, expansions, and contractions of tropical plant species as revealed in dated herbarium records // Glob. Change Biol. V. 18. № 4. P. 1335–1341. https://doi.org/10.1111/j.1365-2486.2011.02602.x
  31. Funk V.A., 2003. 100 uses for an herbarium: Well at least 72 // Am. Soc. Pl. Taxon. Newsl. V. 17. P. 17–19.
  32. Funk V.A., 2018. Collections-based science in the 21st Century // J. Sist. Evol. V. 56. № 3. P. 175–193. https://doi.org/10.1111/jse.12315
  33. Garin E.V., 2023. List of herbariums of Russia // Mendeley Data. Ver. 1. https://doi.org/10.17632/wc9j7xr772.1
  34. Heberlink J.M., Isaak B.L., 2017. Herbarium specimens as exaptations: New uses for old collections // Am. J. Bot. V. 104. P. 963–965. https://doi.org/10.3732/ajb.1700125
  35. Holmes M.W., Hammond T.T., Wogan G.O.U., Walsh R.E., LaBarbera K. et al., 2016. Natural history collections as windows on evolutionary processes // Mol. Ecol. V. 25. P. 864–881. https://doi.org/10.1111/mec.13529
  36. Ivanova N.V., Shashkov M.P., 2016. Biodiversity databases in Russia: Towards a national portal // Arctic Sci. V. 3. № 3. P. 560–576. https://doi.org/10.1139/as-2016-0050
  37. Jarvis R.M., Borrelle S.B., Forsdick N.J., Pérez-Hämmerle K.-V., Dubois N.S. et al., 2020. Navigating spaces between conservation research and practice: Are we making progress? // Ecol. Solut. Evid. V. 1. Art. e12028. https://doi.org/10.1002/2688-8319.12028
  38. Kemp C., 2015. Museums: The endangered dead // Nature. V. 518. P. 292–294. https://doi.org/10.1038/518292a
  39. Knight A.T., Cowling R.M., Rouget M., Balmford A., Lombard A.T., Campbell B.M., 2008. Knowing but not doing: selecting priority conservation areas and the research-implementation gap // Conserv. Biol. V. 22. № 3. P. 610–617. https://doi.org/10.1111/j.1523-1739.2008.00914.x
  40. Lavoie C., 2013. Biological collections in an everchanging world: Herbaria as tools for biogeographical and environmental studies // Perspect. Plant Ecol. Evol. Syst. V. 15. № 1. P. 68–76. https://doi.org/10.1016/j.ppees.2012.10.002
  41. McLean B.S., Bell K.C., Dunnum J.L., Abrahamson B., Colella J.P. et al., 2016. Natural history collections-based research: progress, promise, and best practices // J. Mammal. V. 97. № 1. P. 287–297. https://doi.org/10.1093/jmammal/gyv178
  42. Meineke E.K., Davies T.J., Daru B.H., Davis C.C., 2018. Biological collections for understanding biodiversity in the Anthropocene // Phil. Trans. R. Soc. B. V. 374. Art. 20170386. https://doi.org/10.1098/rstb.2017.0386
  43. Natural-history collections face fight for survival, 2017 // Nature. V. 544. P. 137–138. https://doi.org/10.1038/544137b
  44. Nelson G., Ellis S., 2018. The history and impact of digitization and digital data mobilization on biodiversity research // Phil. Trans. R. Soc. B. V. 374. Art. 20170391. https://doi.org/10.1098/rstb.2017.0391
  45. Nevill P.G., Zhong X., Tonti‑Filippini J., Byrne M., Hislop M. et al., 2020. Large scale genome skimming from herbarium material for accurate plant identification and phylogenomics // Plant Methods. V. 16. Art. 1. https://doi.org/10.1186/s13007-019-0534-5
  46. Nualart N., Ibáñez N., Soriano I., López-Pujol J., 2017. Assessing the relevance of herbarium collections as tools for conservation biology // Bot. Rev. V. 83. P. 303–325. https://doi.org/10.1007/s12229-017-9188-z
  47. Parnell J., 1996. The monetary value of herbarium collections // Systematics and Biological Collections. Abstracts of Papers and Posters / Ed. Rushton B.S. Belfast: Ulster Museum. P. 33–34.
  48. Parnell J., 2001. The monetary value of herbarium collections // Biological Collections & Biodiversity / Eds Rushton B.S., Hackney P., Tyrie C.R. Otley: Linnean Society of London. P. 271–286.
  49. Ronsted N., Grace O.M., Carine M.A., 2020. Editorial: Integrative and translational uses of herbarium collections across time, space, and species // Front. Plant Sci. V. 11. Art. 1319. https://doi.org/10.3389/fpls.2020.01319
  50. Seregin A.P., 2016. Making the Russian flora visible: Fast digitisation of the Moscow University herbarium (MW) in 2015 // Taxon. V. 65. № 1. P. 205–207. https://doi.org/10.12705/651.29
  51. Seregin A.P., 2018. The largest digital herbarium in Russia is now available online! // Taxon. V. 67. № 2. P. 463–467. https://doi.org/10.12705/672.34
  52. Seregin A.P., 2020. Moscow Digital Herbarium: A consortium since 2019. https://www.researchgate.net/publication/339052464_Moscow_Digital_Herbarium_a_consortium_since_2019. https://doi.org/10.13140/RG.2.2.17337.93283
  53. Shenzhen Declaration Drafting Committee, 2017. The Shenzhen Declaration on Plant Sciences – Uniting plant sciences and society to build a green, sustainable Earth // PhytoKeys. V. 86. P. 3–7. https://doi.org/10.3897/phytokeys.86.20859
  54. Vere N., de, Rich T.C.G., Trinder S.A., Long C., 2015. DNA barcoding for plants // Methods Mol. Biol. V. 1245. P. 101–118. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-1966-6_8
  55. Zeng C.-X., Hollingsworth P.M., Yang J., He Z.-S., Zhang Z.-R. et al., 2018. Genome skimming herbarium specimens for DNA barcoding and phylogenomics // Plant Methods. V. 14. Art. 43. https://doi.org/10.1186/s13007-018-0300-0

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Э.В. Гарин, Д.В. Гарина, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».