Исследование ассоциации полиморфных вариантов rs2295080 и rs1883965 гена MTOR с развитием и течением саркоидоза легких

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Цель исследования – изучение ассоциации полиморфных вариантов rs2295080 и rs1883965 гена MTOR с риском развития саркоидоза легких. В исследование включено 253 человека (122 больных с диагнозом морфологически верифицированный саркоидоз с поражением легких (средний возраст – 41.00 ± 12.56 года) и 131 здоровый человек (контрольная группа) (средний возраст – 44.00 ± 14.23 года)). В исследование включены жители Республики Карелия. В исследуемых группах проанализировано распределение аллелей и генотипов полиморфных маркеров rs2295080 и rs1883965 гена MTOR. Генотипирование проводили с помощью ПЦР-ПДРФ анализа. Уровень транскриптов гена MTOR в лейкоцитах периферической крови (ЛПК) больных саркоидозом легких и здоровых людей оценивали с помощью ПЦР в режиме реального времени. Установлено статистически значимое повышение уровня экспрессии мРНК гена MTOR в ЛПК больных саркоидозом легких по сравнению с контрольной группой (р = 0.007). Отмечено снижение количества транскриптов указанного гена у пациентов, получающих терапию по сравнению с пациентами без терапии (p = 0.025). Cтатистически значимых различий в распределении частот аллелей и генотипов по полиморфным маркерам rs2295080 и rs1883965 гена MTOR в группе больных саркоидозом легких и в контрольной группе не установлено (χ2 = 0.196, d.f. = 1, p = 0.658 и χ2 = 0.637, d.f. = 2, p = 0.728) и (χ2 = 0.034, d.f. = 1, p = = 0.855 и χ2 = 0.051, d.f. = 2, p = 0.975) соответственно. Повышенный уровень экспрессии гена MTOR в лейкоцитах периферической крови больных саркоидозом легких может свидетельствовать о вовлечении указанного гена в патогенез данного заболевания. Полиморфные маркеры rs2295080 и rs1883965 гена MTOR не связаны с риском развития саркоидоза легких. Вероятно, повышение уровня экспрессии гена MTOR у больных саркоидозом легких обусловлено развитием воспаления.

Об авторах

И. Е. Малышева

Институт биологии – обособленное подразделение Федерального государственного бюджетного учреждения науки Федерального исследовательского центра “Карельский научный центр Российской академии наук”

Автор, ответственный за переписку.
Email: i.e.malysheva@yandex.ru
Россия, 185910, Петрозаводск

Л. В. Топчиева

Институт биологии – обособленное подразделение Федерального государственного бюджетного учреждения науки Федерального исследовательского центра “Карельский научный центр Российской академии наук”

Email: i.e.malysheva@yandex.ru
Россия, 185910, Петрозаводск

Э. Л. Тихонович

Республиканская больница им. В.А. Баранова

Email: i.e.malysheva@yandex.ru
Россия, 185019, Петрозаводск

Список литературы

  1. Sarbassov D.D., Ali S.M., Kim D.H. et al. Rictor, a novel binding partner of mTOR, defnes a rapamycin-insensitive and raptor-independent pathway that regulates the cytoskeleton // Curr. Biol. 2004. V. 14. P. 1296–1302. https://doi.org/10.1016/j.cub.2004.06.054
  2. Huang S. mTOR signaling in metabolism and cancer // Cells. 2020. V. 9. № 10. https://doi.org/10.3390/cells9102278
  3. Linke M., Pham H.T., Katholnig K. et al. Chronic signaling via the metabolic checkpoint kinase mTORC1 induces macrophage granuloma formation and marks sarcoidosis progression // Nat. Immunol. 2017. V. 18. № 3. P. 293–302. https://doi.org/10.1038/ni.3655
  4. Шмелёв Е.И. Саркоидоз // Атмосфера, пульмонология и аллергология. 2004. № 2. С. 3–10.
  5. Малышева И.Е., Тихонович Э.Л., Олейник Е.К. и др. Поляризация макрофагов при саркоидозе // Мед. иммунология. 2021. Т. 23. № 1. P. 7–16. https://doi.org/10.15789/1563-0625-MPI-2083
  6. Пархитько А.А., Фаворова О.О., Хабибуллин Д.И. и др. Киназ аmTOR: регуляция, роль в поддержании клеточного гомеостаза, развитии опухолей и старении // Биохимия. 2014. Т. 79. № 2. С. 128–143.
  7. Jhanwar-Uniyal M., Amin A.G., Cooper J.B. Discrete signaling mechanisms of mTORC1 and mTORC2: Connected yet apart in cellular and molecular aspects // Adv. Biol. Regul. 2017. V. 64. P. 39–48. https://doi.org/10.1016/j.jbior.2016.12.001
  8. Locke L., Schlesinger L., Crouser E. Current sarcoidosis models and the importance of focusing on the granuloma // Front. Immunol. 2020. V. 11. https://doi.org/10.3389/fimmu.2020.01719
  9. Pouché L., Stojanova J., Pierre Marquet P., Picard N. New challenges and promises in solid organ transplantation pharmacogenetics: The genetic variability of proteins involved in the pharmacodynamics of immunosuppressive drugs // Pharmacogenomics. 2016. V. 17. № 3. P. 277–296. https://doi.org/10.2217/pgs.15.169
  10. Xu M., Gao Y., Yu T. Functional promoter rs2295080 T>G variant in MTOR gene is associated with risk of colorectal cancer in a Chinese population // Biomedicine & Pharmacotherapy. 2015. V. 70. P. 28–32. https://doi.org/10.1016/j.biopha.2014.12.045
  11. Lan J., Zhu Y., Rao J. et al. MTOR gene polymorphism may be associated with microscopic polyangiitis susceptibility in a Guangxi population of China // Gene. 2023. V. 854. https://doi.org/10.1016/j.gene.2022.147101
  12. Min Z., Mi Y., Lv Z. et al. Associations of Genetic Polymorphisms of mTOR rs2295080 T/G and rs1883965 G/A with Susceptibility of Urinary System Cancers // Dis. Markers. 2022. V. 17. https://doi.org/10.1155/2022/1720851
  13. Paterno J., Koskela A., Hyttinen J. Autophagy genes for wet age-related macular degeneration in a finnish case-control study // Genes. 2020. V. 11. P. 1318. https://doi.org/10.3390/genes11111318
  14. Li H., Liu Y., Huang J. et al. Association of genetic variants in lncRNA GAS5/miR-21/mTOR axis with risk and prognosis of coronary artery disease among a Chinese population // J. Clin. Lab. Anal. 2020. V. 34. № 10. https://doi.org/10.1002/jcla.23430
  15. Baughman R.P., Culver D.A., Judson M.A. A concise review of pulmonary sarcoidosis // Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2011. V. 183. № 5. P. 573–581. https://doi.org/10.1164/rccm.201006-0865CI
  16. Bizhani F., Hashemi M., Danesh H. et al. Association between single nucleotide polymorphisms in the PI3K/AKT/mTOR pathway and bladder cancer risk in a sample of Iranian population // EXCLI J. 2018. V. 17. P. 3–13. https://doi.org/10.17179/excli2017-329
  17. Клинические рекомендации по саркоидозу Минздрава России. М., 2022. С. 30–31.
  18. Pinto J., Dias V., Zoller H. et al. Hepcidin messenger RNA xpression in human lymphocytes // Immunology. 2010. V. 130. № 2. P. 217–230. https://doi.org/10.1111/j.1365-2567.2009.03226.x
  19. Корнилов Д.О., Тряпицын М.А., Гребнев Д.Ю. MTOR: сигнализация, регуляция, влияние на метаболизм, роль в регуляции продолжительности жизни и опухолевого роста // Изв. Коми научного центра УрО РАН. 2021. № 5. С. 104–115. https://doi.org/10.19110/1994-5655-2021-5-104-115
  20. Rubie C., Zimmer J., Lammert F. MicroRNA-496 and mechanistic target of rapamycin expression are associated with type 2 diabetes mellitus and obesity in elderly people // Ann. Nutr. Metab. 2019. V. 74. № 4. P. 279–286. https://doi.org/10.1159/000499576
  21. Rahtes A., Geng S., Lee C., Li L. Cellular and molecular mechanisms involved in the resolution of innate leukocyte inflammation // J. Leukoc. Biol. 2018. V. 104. № 3. P. 535–541. https://doi.org/10.1002/JLB.3MA0218-070R
  22. Li Y., Zhao P., Yue X. et al. Association of mTOR polymorphisms with cancer risk and clinical outcomes: a meta-analysis // PLoS One. 2014. V. 9. № 5. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0097085
  23. Cao Q., Ju X., Li P. A functional variant in the MTOR promoter modulates its expression and is associated with renal cell cancer risk // PLoS One. 2012. V. 7. № 11. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0050302
  24. Saravani M., Shahraki-Ghadimi H., Maruei-Milan R. et al. Effects of the mTOR and AKT genes polymorphisms on systemic lupus erythematosus risk // Mol. Biol. Rep. 2020. V. 47. № 5. P. 3551–3556. https://doi.org/10.1007/s11033-020-05446-y
  25. Shao J., Li Y., Zhao P. et al. Association of mTOR polymorphisms with cancer risk and clinical outcomes: A meta-analysis // PLoS One. 2014. V. 9. № 5. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0097085
  26. Zining J., Lu X., Caiyun H., Yuan Y. Genetic polymorphisms of mTOR and cancer risk: A systematic review and updated meta-analysis // Oncotarget. 2016. V. 7. № 35. P. 57464–57480. https://doi.org/10.18632/oncotarget.10805
  27. Wang M., Ma S.J., Wu X.Y. et al. Impact of mTOR gene polymorphisms and gene-tea interaction on susceptibility to tuberculosis // J. Clin. Cases. 2020. V. 8. № 19. P. 4320–4330. https://doi.org/10.12998/wjcc.v8.i19.4320
  28. Николаев А.В., Утехин В.И., Чурилов Л.П. Сравнительная этио-эпидемиологическая характеристика туберкулеза и саркоидоза легких: классические и новые представления // Педиатрия. 2020. Т. 11. № 5. С. 37–50. https://doi.org/10.17816/PED11537-50
  29. He J., Wang M., Qiu L. et al. Genetic variations of mTORC1 genes and risk of gastric cancer in an Eastern Chinese population // Mol. Carcinog. 2013. V. 52. Suppl. 1. P. E70-9. https://doi.org/10.1002/mc.22013

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2.

Скачать (40KB)
Метаданные

© И.Е. Малышева, Л.В. Топчиева, Э.Л. Тихонович, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».