Разработка математической модели прогнозирования риска шизофрении на основе оценки носительства полиморфных аллелей в 13 генетических локусах, влияющих на обмен птеринов

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Методом ПЦР в режиме реального времени проведен анализ носительства аллелей в 13 генетических локусах, влияющих на обмен птеринов, у 116 пациентов с шизофренией и 62 здоровых добровольцев. Для анализа точности прогнозирования риска шизофрении использовался метод бинарной логистической регрессии с оценкой вклада всех изученных локусов. Разработана математическая модель, которая позволяет спрогнозировать риск развития шизофрении у носителя комбинации генотипов MTHFD1 1958СС/MTRR 66GG с вероятностью 90.6%, MTHFD1 1958СС/MTRR 66AG – с вероятностью 81.9%. Применение данной модели целесообразно в рутинной психиатрической практике среди лиц высокого риска развития шизофрении, однако для внедрения полученных данных в практическое здравоохранение необходима репликация в других выборках с большим объемом наблюдений.

Об авторах

Т. В. Жиляева

Приволжский исследовательский медицинский университет; Национальный медицинский исследовательский центр психиатрии
и неврологии им. В.М. Бехтерева

Автор, ответственный за переписку.
Email: bizet@inbox.ru
Россия, 603005, Нижний Новгород; Россия, 192019, Санкт-Петербург

А. П. Баврина

Приволжский исследовательский медицинский университет

Email: bizet@inbox.ru
Россия, 603005, Нижний Новгород

Е. Д. Касьянов

Национальный медицинский исследовательский центр психиатрии
и неврологии им. В.М. Бехтерева

Email: bizet@inbox.ru
Россия, 192019, Санкт-Петербург

А. С. Благонравова

Приволжский исследовательский медицинский университет

Email: bizet@inbox.ru
Россия, 603005, Нижний Новгород

Г. Э. Мазо

Национальный медицинский исследовательский центр психиатрии
и неврологии им. В.М. Бехтерева

Email: bizet@inbox.ru
Россия, 192019, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Wang D., Zhai J.X., Liu D.W. Serum folate levels in schizophrenia: a meta-analysis // Psych. Res. 2016. V. 235. P. 83–89. https://doi.org/10.1016/j.psychres.2015.11.045
  2. Ayesa-Arriola R., Pérez-Iglesias R., Rodríguez-Sánchez J.M. et al. Homocysteine and cognition in first-episode psychosis patients // Eur. Arch. Psych. Clin. Neurosci. 2012. V. 262. № 7. P. 557–564. https://doi.org/10.1007/s00406-012-0302-2
  3. Numata S., Kinoshita M., Tajima A. et al. Evaluation of an association between plasma total homocysteine and schizophrenia by a Mendelian randomization analysis // BMC Med. Genet. 2015. V. 16. № 1. P. 54. https://doi.org/10.1186/s12881-015-0197-7
  4. Nishi A., Numata S., Tajima A. et al. Meta-analyses of blood homocysteine levels for gender and genetic association studies of the MTHFR C677T polymorphism in schizophrenia // Schizophrenia Bull. 2014. V. 40. № 5. P. 1154–1163. https://doi.org/10.1093/schbul/sbt154
  5. Zhang Y., Hodgson N.W., Trivedi M.S. et al. Decreased brain levels of vitamin B12 in aging, autism and schizophrenia // PLoS One. 2016. V. 11. № 1. P. E0146797. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0146797
  6. Klaus F., Guetter K., Schlegel R. et al. Peripheral biopterin and neopterin in schizophrenia and depression // Psych. Res. 2021. V. 297. P. 113745. https://doi.org/10.1016/j.psychres.2021.113745
  7. Yadav U., Kumar P., Gupta S., Rai V. Role of MTHFR C677T gene polymorphism in the susceptibility of schizophrenia: An updated meta-analysis // As. J. Psych. 2016. V. 20. P. 41–51. https://doi.org/10.1016/j.ajp.2016.02.002
  8. Kempisty B., Sikora J., Lianeri M. et al. MTHFD 1958G>A and MTR 2756A>G polymorphisms are associated with bipolar disorder and schizophrenia // Psych. Genet. 2007. V. 17. № 3. P. 177–181. https://doi.org/10.1097/YPG.0b013e328029826f
  9. Lajin B., Alhaj Sakur A., Michati R., Alachkar A. Association between MTHFR C677T and A1298C, and MTRR A66G polymorphisms and susceptibility to schizophrenia in a Syrian study cohort // As. J. Psych. 2012. V. 5. № 2. P. 144–149. https://doi.org/10.1016/j.ajp.2012.03.002
  10. Clelland J.D., Read L.L., Smeed J., Clelland C.L. Regulation of cortical and peripheral GCH1 expression and biopterin levels in schizophrenia-spectrum disorders // Psych. Res. 2018. V. 262. P. 229–236.https://doi.org/10.1016/j.Psychres.2018.02.020
  11. Жиляева Т.В., Сергеева А.В., Благонравова А.С. и др. Нарушения одноуглеродного метаболизма при шизофрении: генетические и терапевтические аспекты // Нейрохимия. 2019. Т. 36. № 2. С. 91–100. https://doi.org/10.1134/S1027813319020158
  12. Yang B., Liu Y., Li Y. et al. Geographical distribution of MTHFR C677T, A1298C and MTRR A66G gene polymorphisms in China: Findings from 15357 adults of Han nationality // PLoS One. 2013. V. 8. № 3. P. E57917. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0057917
  13. Binia A., Contreras A.V., Canizales-Quinteros S. et al. Geographical and ethnic distribution of single nucleotide polymorphisms within genes of the folate/homocysteine pathway metabolism // Genes & Nutr. 2014. V. 9. № 5. P. 421. https://doi.org/10.1007/s12263-014-0421-7
  14. Yao X., Glessner J.T., Li J. et al. Integrative analysis of genome-wide association studies identifies novel loci associated with neuropsychiatric disorders // Transl. Psych. 2021. V. 11. № 1. P. 69. https://doi.org/10.1038/s41398-020-01195-5
  15. Moruzzi S., Guarini P., Udali S. et al. One-carbon genetic variants and the role of MTHFD1 1958G>A in liver and colon cancer risk according to global DNA methylation // PLoS One. 2017. V. 12. № 10. P. e0185792. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0185792
  16. Zhilyaeva T.V., Chekanina O.M., Blagonravova A.S. et al. Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase-1 (MTHFD1) 1958G>A genetic polymorphism (rs2236225) is associated with lower schizophrenia risk: Preliminary study // Gene Rep. 2022. V. 27. P. 101625. https://doi.org/10.1016/j.genrep.2022.101625
  17. Roffman J.L., Brohawn D.G., Nitenson A.Z. et al. Genetic variation throughout the folate metabolic pathway influences negative symptom severity in schizophrenia // Schiz. Bull. 2011. V. 39. № 2. P. 330–338. https://doi.org/10.1093/schbul/sbr150
  18. Wan L., Li Y., Zhang Z. et al. Methylenetetrahydrofolate reductase and psychiatric diseases // Transl. Psych. 2018. V. 8. № 1. P. 242. https://doi.org/10.1038/s41398-018-0276-6
  19. Roffman J.L., Lamberti J.S., Achtyes E. et al. Randomized multicenter investigation of folate plus vitamin B12 supplementation in schizophrenia // Jama Psych. 2013. V. 70. № 5. P. 481. https://doi.org/10.1001/jamapsychiatry.2013.900
  20. Жиляева Т.В., Благонравова А.С., Мазо Г.Э. Влияние разных форм фолатов на когнитивные функции у больных хронической шизофренией // Журн. неврол. и психиатрии им. C.C. Корсакова. 2020. Т. 120. № 9. С. 87–92. https://doi.org/10.17116/jnevro202012009187
  21. Htun N.C., Miyaki K., Zhao C. et al. Epistasis effects of COMT and MTHFR on inter-individual differences in mental health: Under the inverted U-shaped prefrontal dopamine model // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2014. V. 451. № 4. P. 574–579. https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2014.08.023
  22. Галинская Т.В., Щепетов Д.М., Лысенков С.Н. Предубеждения о микросателлитных исследованиях и как им противостоять // Генетика. 2019. Т. 55. № 6. С. 617–632. https://doi.org/10.1134/S0016675819060043

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Т.В. Жиляева, А.П. Баврина, Е.Д. Касьянов, А.С. Благонравова, Г.Э. Мазо, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».