Historical Genetics

Capa

Citar

Texto integral

Acesso aberto Acesso aberto
Acesso é fechado Acesso está concedido
Acesso é fechado Somente assinantes

Resumo

New developments in the field of genomic technologies has engendered novel opportunities for the genetic researches of historical and archaeological sites, thus giving rise to a new field of genetic science, which we have previously proposed to designate as historical genetics. Historical genetics is the scientific study of the history of humankind and ancient objects based on DNA analysis. Ancient DNA preserved in archaeological, museum and archival samples is a unique source of information that allows the integration of genetic data with archaeological and historical information, as well as historical identifications that were previously unavailable for research. The purpose of this article is twofold: firstly, to provide an overview of historical genetics using the example of applying ancient DNA analysis methodologies in our own research; and secondly, to consider the main promising areas of research in this field of science. These include a large-scale scientific project to study the genetic history of ancient populations within the framework of an interdisciplinary scientific consortium of leading Russian scientific institutions.

Sobre autores

E. Rogaev

Scientific Center of Genetics and Life Sciences, Sirius University; Chan Medical School of the University of Massachusetts, Department of Psychiatry

Autor responsável pela correspondência
Email: contact@rogaevlab.ru
Sirius Federal Territory, Krasnodarsky Krai, village Sirius, 354340 Russia; Shrewsbury, 01545 USA

Bibliografia

  1. Prufer K., de Filippo C., Grote S. et al. A high-coverage Neandertal genome from Vindija Cave in Croatia // Science. 2017. V. 358. № 6363. P. 655–658. https://doi.org/10.1126/science.aao1887
  2. Mafessoni F., Grote S., de Filippo C. et al. A high-coverage Neandertal genome from Chagyrskaya Cave // PNAS USA. 2020. V. 117. № 26. P. 15132–15136. https://doi.org/10.1073/pnas.2004944117
  3. Reich D., Green R., Kircher M. et al. Genetic history of an archaic hominid group from Denisova cave in Siberia // Nature. 2010. № 468. P. 1053–1060. https://doi.org/10.1038/nature09710
  4. Furholt M. Mobility and social change: Understanding the European neolithic period after the archaeogenetic revolution // J. Archaeol. Res. 2021. № 29. P. 481–535. https://doi.org/10.1007/s10814-020-09153-x
  5. Lazaridis I., Patterson N., Anthony D. et al. The genetic origin of the Indo-Europeans // Nature. 2025. № 639. P. 132–142. https://doi.org/10.1038/s41586-024-08531-5
  6. Rogaev E.I., Grigorenko A.P., Moliaka Y.K. et al. Genomic identification in the historical case of the Nicholas II royal family // PNAS USA. 2009. V. 106. № 13. P. 5258–5263. https://doi.org/10.1073/pnas.0811190106
  7. Rogaev E.I., Grigorenko A.P., Faskhutdinova G. et al. Genotype analysis identifies the cause of the “royal disease” // Science. 2009. V. 326. № 5954. P. 817. https://doi.org/10.1126/science.1180660
  8. Андреева Т.В., Манахов А.Д., Кунижева С.С., Рогаев Е.И. Генетическое свидетельство аутентичности локона волос, представленного как реликвия в музейном портрете цесаревича Алексея, сына последнего российского императора // Биохимия. 2021. № 86. С. 1818–1825. https://doi.org/10.31857/S032097252112006X
  9. Андреева Т.В., Малярчук А.Б., Сошкина А.Д. и др. Методологии выделения древней ДНК из костной ткани для геномного анализа: подходы и практические рекомендации // Генетика. 2022. Т. 58. № 9. С. 979–998. https://doi.org/10.31857/S001667582209003X
  10. Prufer K., Stenzel U., Hofreiter M. et al. Computational challenges in the analysis of ancient DNA // Genome Biol. 2010. V. 11. № 5. https://doi.org/10.1186/gb-2010-11-5-r47
  11. Rogaev E.I., Moliaka Y.K., Malyarchuk B.A. et al. Complete mitochondrial genome and phylogeny of pleistocene mammoth Mammuthus primigenius // PLoS Biol. 2006. V. 4. № 3. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0040073
  12. Andreeva T.V., Manakhov A.D., Gusev F.E. et al. Genomic analysis of a novel neandertal from Mezmaiskaya Cave provides insights into the genetic relationships of middle palaeolithic populations // Sci. Rep. 2022. V. 12. P. 13016. https://doi.org/10.1038/s41598-022-16164-9
  13. Андреева Т.В., Жилин М.Г., Малярчук А.Б. и др. Археогеномиз человека из слоя верхневолжской культуры – наибольшее генетическое сходство с восточно-европейскими охотниками-собирателями и древними представителями мезолита/неолита Европы // Вестник археол., антропол. и этнографии. 2024. № 1(64). С. 113–125. https://doi.org/10.20874/2071-0437-2024-64-1-10
  14. Andreeva T.V., Soshkina A.D., Gusev F.E. et al. Genetic history of Scythia // Sci. Adv. 2025 V. 11. P. 8179. http://doi.org/10.1126/sciadv.ads8179
  15. Андреева Т.В., Малярчук А.Б., Григоренко А.П. и др. Археогенетический анализ индивида из захоронения с территории древнего Ярославского Кремля // Краткие сообщ. Ин-та археологии. 2021. № 265. С. 294–308. https://doi.org/10.25681/IARAS.0130-2620.265.294-308
  16. Андреева Т.В., Добровольская М.В., Седов В.В. и др. Люди из каменного саркофага № 11 Юрьева монастыря: генетическая история на основе митохондриальных геномов // Краткие сообщ. Ин-та археологии. 2023. № 270. С. 418–437. https://doi.org/10.25681/IARAS.0130-2620.270.418-437
  17. Андреева Т.В., Малярчук А.Б., Родинкова В.Е. и др. Индивидуальный вектор времени из Куриловки: первые археогенетические данные // Рос. археология. 2023. № 3. С. 57–71. https://doi.org/10.31857/S0869606323030030
  18. Рождественских Е.В., Манахов А.Д., Андреева Т.В. и др. Юноша с хорьком из средневекового могильника Минино на Кубенском озере: археогенетическая идентификация // Краткие сообщ. Ин-та археологии. 2024. № 274. С. 348–368. https://doi.org/10.25681/IARAS.0130-2620.274.348-368
  19. Сыроватко А.С., Андреева Т.В., Кунижева С.С. и др. Индивид из куранного погребения XII в. на Средней Оке – опыт комплексного археолого-генетического исследования // Вестник археол., антропол. и этнографии. 2024. Т. 2. № 65. С. 123–136. https://doi.org/10.20874/2071-0437-2024-65-2-10
  20. Сошкина А.Д., Андреева Т.В., Кунижева С.С. и др. Генетическое исследование музейного антропологического образца из городского захоронения Старой Рязани XI–XIII веков // Генетика. 2025. Т. 61. № 6. С. 706–716. https://doi.org/10.1134/S1022795425700231
  21. Альперович А.И., Сошкина А.Д., Андреева Т.В. и др. Генетический портрет индивида из средневекового некрополя «Патриарший сад» (г. Владимир) с редкой погребальной обрадностью – каменной подушкой // Вестник археол., антропол. и этнографии. 2025 (в печати).
  22. Рождественских Е.В., Андреева Т.В., Малярчук А.Б. и др. Митогеномный анализ представителя черняховской культуры в Среднем Поднестровье и его генетическая связь со славянами в контексте палеоантропологических данных // Вавилов. журн. генет. и селекции. 2025 (в печати).
  23. Малярчук А.Б., Кузнецова И.Л., Андреева Т.В. и др. Оценка возможности геномного исследования кремлированных археологических образцов // Краткие сообщ. Ин-та археологии. 2025 (в печати).
  24. Niirauen L., Leciej D., Edlund H. et al. Epigenomic modifications in modern and ancient genomes // Genes (Basel). 2022. V. 13. № 2. https://doi.org/10.3390/genes13020178
  25. Малярчук А.Б., Андреева Т.В., Кузнецова И.Л. и др. Геномика древних патогенов: первые успехи и перспективы // Биохимия. 2022. № 87. С. 242–258. https://doi.org/10.1134/S000629792030051

Arquivos suplementares

Arquivos suplementares
Ação
1. JATS XML
Baixar

Declaração de direitos autorais © Russian Academy of Sciences, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».