Отправить статью по E-mail 
ТЕПЛОВЫЕ ПРОЦЕССЫ ПРИ ЭЛЕКТРОФОРЕЗЕ В УСЛОВИЯХ ВЫСОКОЙ ИОННОЙ СИЛЫ
- Авторы: Сирота Н.П1, Хижняк Е.П1, Хижняк Л.Н1, Сирота Т.В1, Кузнецова Е.А1
-
Учреждения:
- Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН
- Выпуск: Том 70, № 1 (2025)
- Страницы: 137-143
- Раздел: Биофизика cложныx cиcтем
- URL: https://bakhtiniada.ru/0006-3029/article/view/285392
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0006302925010162
- EDN: https://elibrary.ru/LUMFXB
- ID: 285392
Цитировать
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Только для подписчиков
Аннотация
Ранее нами была показана температурная неоднородность электрофоретического раствора, динамически изменяющаяся в процессе электрофореза в области платформы для гелей. Чтобы понять причины этого эффекта мы применили П-образные вставки в колодцы электрофоретической камеры, выступающие над поверхностью электрофоретического раствора, но не влияющие на протекание тока. Проведенное исследование показало, что миграция нагретых масс раствора обусловлена разной скоростью продукции водорода и кислорода на платиновых электродах. Используя технику теплового мониторинга в реальном времени, мы показали, что в случае использования П-образных вставок нагрев имеет однородный характер вплоть до 7°С по всему объему раствора, находящемуся над платформой для гелей. В области колодцев нагрев жидкости происходил с меньшей динамикой и не идентично. В колодце катода нагрев жидкости происходит незначительно (всего 1.5°С), а у анода прирост составляет 2.5°С. Мы полагаем, что температурная однородность будет иметь существенное значение для снижения вариабельности результатов, получаемых методом Comet assay (ДНК-комет) на препаратах, подвергающихся щелочному электрофорезу.
Ключевые слова
Об авторах
Н. П Сирота
Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН
Email: sirota@iteb.ru
Пущино, Россия
Е. П Хижняк
Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАНПущино, Россия
Л. Н Хижняк
Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАНПущино, Россия
Т. В Сирота
Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАНПущино, Россия
Е. А Кузнецова
Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАНПущино, Россия
Список литературы
- Khizhnyak E. P., Sirota N. P., Kuznetsova E. A., Khizhnyak L. N., and Sirota T. V. Heating and convection are associated with alkaline electrophoresis. Electrophoresis, 42 (9–10), 1153–1157 (2021). doi: 10.1002/elps.202000337
- Cordelli E., Bignami M., and Pacchierotti F. Comet assay: A versatile but complex tool in genotoxicity testing. Toxicol. Res., 10 (1), 68–78 (2021). doi: 10.1093/toxres/tfaa093
- Bajpayee M., Kumar A., and Dhawan A. Chapter 1: The Comet Assay: A Versatile Tool for Assessing DNA Damage. In: The comet assay in toxicology, Ed. by D. Anderson and A. Dhawan, 2nd ed. (The Royal Society of Chemistry, Cambridge, UK, 2016), ch. 1, pp. 3–64. doi: 10.1039/9781782622895-00001
- Olive P. L. and Banáth J. P. The comet assay: A method to measure DNA damage in individual cells. Nature Protocols, 1 (1), 23–29 (2006). doi: 10.1038/nprot.2006.5
- Ostling O. and Johanson K. J. Microelectrophoretic study of radiation-induced DNA damages in individual mammalian cells. Biochem. Biophys. Res. Commun., 123 (1), 291–298 (1984). doi: 10.1016/0006-291x(84)90411-x
- Kuznetsova E. A., Sirota N. P., Mitroshina I. Y., Pikalov V. A., Smirnova E. N., Rozanova O. M., Glukhov S. I., Sirota T. V., and Zaichkina S. I. DNA damage in blood leukocytes from mice irradiated with accelerated carbon ions with an energy of 450MeV/nucleon. Int. J. Radiat. Biol., 96, 1245–1253 (2020).
- Møller P., Azqueta A., Collia M., Bakuradze T., Richling E., Bankoglu E. E., Stopper H., Bastos V. C., Langie S. A. S., Jensen A., Ristori S., Scavone F., Giovannelli L., Wojewódzka M., Kruszewski M., Valdiglesias V., Laffon B., Costa C., Costa S., Teixeira J. P., Marino M., Del Bo C., Riso P., Zheng C., Shaposhnikov S., Collins A. Inter-laboratory variation in measurement of DNA damage by the alkaline comet assay in the hCOMET ring trial. Mutagenesis, 38, 283–294 (2023). doi: 10.1093/mutage/gead014
- Owiti N. A., Kaushal S., Martin L., Sly J., Swartz C. D., Fowler J., Corrigan J. J., Recio L., and Engelward B. P. Using the hepaCometChip Assay for broad-spectrum DNA damage analysis. Current Protocols, 2, e563 (2022). doi: 10.1002/cpz1.563
- Singh N. P., McCoy M. T., Tice R. R., and Schneider E. L. A simple technique for quantitation of low levels of DNA damage in individual cells. Exp. Cell Res., 175 (1), 184–191 (1988). doi: 10.1016/0014-4827(88)90265-0
- Lafleur M. V., van Heuvel M., Woldhuis J., and Loman H. Alkali-labile sites and post-irradiation effects in single-stranded DNA induced by OH radicals. Int. J. Radiat. Biol. Relat. Stud. Phys. Chem. Med., 33 (3), 273–281 (1978). doi: 10.1080/09553007814550151
- Lafleur M. V., Woldhuis J., and Loman H. Alkali-labile sites and post-irradiation effects in gamma-irradiated biologically active double-stranded DNA in aqueous solution. Int. J. Radiat. Biol. Relat. Stud. Phys. Chem. Med., 36 (3), 241–247 (1979). doi: 10.1080/09553007914551011
- Сирота Н. П. и Гапеев А. Б. Набор и способ для приготовления многослойных агарозных блоков на поверхности мини-стекол для микроскопии. Патент на изобретение RU 2558229 C2, 27.07.2015. Заявка № 2013117949/10 от 19.04.2013.
- Kuznetsova E. A., Dyukina A. R., Chernigina I. A., and Sirota N. P. A method of low-temperature storing of agarose slides with lysed cells. Bull. Exp. Biol. Med., 155 (6), 757–759 (2013). doi: 10.1007/s10517-013-2245-7
Дополнительные файлы
