Влияние pH на конформацию модифицированного аптамера к белку нуклеолину

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Поиск агентов для адресной доставки противораковых препаратов остается крайне востребованной для медицины задачей. В этой связи находят свое применение ДНК-аптамеры к белкам, специфичным к раковым клеткам. Вместе с тем дополнительная настройка активности аптамеров для снижения их аффинности к мишеням вне раковых тканей может улучшить перспективы их клинического применения ввиду сокращения иммуногенности и количества побочных эффектов. Одним из подходов является использование нарушения кислотности в раковых клетках и тканях. В данной работе мы модифицировали аптамер AS1411 к нуклеолину путем присоединения к нему нуклеотидной последовательности, сообщающей аптамеру свойство pH-чувствительности. Методами спектрофотометрического плавления и флуоресценции было продемонстрировано, что конформация нового аптамера обусловлена pH среды.

Об авторах

П. В Габрусенок

Санкт-Петербургский государственный университет

Санкт-Петербург, Россия

Р. Р Рамазанов

Севастопольский государственный университет

Севастополь, Россия

А. С Бучельников

Севастопольский государственный университет

Севастополь, Россия

П. А Соколов

Санкт-Петербургский государственный университет;Севастопольский государственный университет

Email: p.a.sokolov@spbu.ru
Санкт-Петербург, Россия;Севастополь, Россия

Список литературы

  1. F. Mongelard and P. Bouvet, Trends Cell Biol., 17 (2), 80 (2007).
  2. S. Christian, J. Pilch, M. E. Akerman, et al., J. Cell Biol., 163 (4), 871 (2003).
  3. J. Mosafer and A. Mokhtarzadeh, Curr. Drug Delivery, 15 (9), 1323 (2018).
  4. C. Brignole, V. Bensa, N. A. Fonseca, et al., J. Exp. Clin. Cancer Res., 40 (1), 180 (2021).
  5. J. BalQa-Silva, A. do Carmo, H. Tao, et al., Exp. Cell Res., 370 (1), 68 (2018).
  6. V. Moura, M. Lacerda, P. Figueiredo, et al., Breast Cancer Res. Treat., 133 (1), 61 (2012).
  7. J. Carvalho, A. Paiva, M. P. Cabral Campello, et al., Sci. Rep., 9 (1), 7945 (2019).
  8. N. F. Hosseini, R. Amini, M. Ramezani, et al., Biomed. Pharmacother., 155, 113690 (2022).
  9. С. П. Радько, С. Ю. Рахметова, Н. В. Бодоев и др., Биомед. химия, 53 (1), 5 (2007).
  10. С. А. Лапа, В. Е. Шершов, Г. С. Краснов и др., Биоорг. химия, 46 (4), 411 (2020).
  11. Z. Fu and J. Xiang, Int. J. Mol. Sci., 21 (8), 2793 (2020).
  12. R. Yazdian-Robati, P. Bayat, F. Oroojalian, et al., Int. J. Biol. Macromol., 155, 1420 (2020).
  13. B. A. Webb, M. Chimenti, M. P. Jacobson, et al., Nat. Rev. Cancer, 11 (9), 671 (2011).
  14. M. Damaghi, J. W. Wojtkowiak, and R. J. Gillies, Front. Physiol. 4, 370 (2013).
  15. I. A. P. Thompson, L. Zheng, M. Eisenstein, et al., Nat.Commun., 11 (1), 2946 (2020).
  16. M. Debiais, A. Lelievre, M. Smietana, et al., Nucl. Acids Res., 48 (7), 3400 (2020).
  17. https://eu.idtdna.com/calc/analyzer.
  18. P. A. Rachwal and K. R. Fox, Methods, 43 (4), 291 (2007).
  19. J. A. Lee and M. C. DeRosa, Chem.Commun., 46 (3), 418 (2010).
  20. L. Bie, Y. Wang, F. Jiang, et al., Front. Mol. Biosci., 9, 1025313 (2022).
  21. F. C. Simmel, B. Yurke, and H. R. Singh, Chem. Rev., 119 (10), 6326 (2019).
  22. S. E. Morse and D. E. Draper, Nucl. Acids Res., 23 (2), 302 (1995).

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».